神秘动物学家对莫图卡的存在持有更为开放的态度。神秘动物学是一个相对年轻的学科，致力于研究未确认的生物体，并试图通过目击报告和科学考察找到这些生物的真实存在。虽然它并非主流科学的一部分，但也有不少学者对这一领域表现出浓厚的兴趣。

知名神秘动物学家伯纳德·舒维尔曼斯曾在他的着作《海怪与怪物》中提到：“刚果雨林的生态系统是地球上最难以探索的区域之一。它的复杂性和封闭性，使得一些古老的物种得以存活，而不被现代科学发现。”舒维尔曼斯认为，莫图卡可能是一种未被发现的远古生物，类似于蛇颈龙这种已经灭绝的爬行动物。

他的观点虽然引起了广泛的争议，但也为莫图卡的存在提供了一种合理的解释。蛇颈龙是一种生活在侏罗纪时期的海洋爬行动物，它们以长颈和巨大的体型着称。尽管科学家普遍认为它们已经在白垩纪末期灭绝，但一些神秘动物学家认为，类似蛇颈龙的生物可能在地球某些偏远地区继续存活，刚果雨林的广袤区域可能正是它们的栖息地。

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除了探险者和科学家的报告，当地土着居民的口述历史中也有关于莫图卡的描述。刚果雨林的巴图族居民世世代代生活在这片土地上，他们的神话和传说中，常常提到一种巨大的水生怪物，名为“姆博肯贝”。这种生物的名字在班图语中意为“阻挡河流的生物”，据传它的体型庞大，足以阻挡河流的正常流动。

姆博肯贝与莫图卡之间的联系，成为许多人推测莫图卡可能是真实存在的原因之一。巴图族的传说虽然带有明显的神话色彩，但它们是否基于某种现实的生物仍然值得进一步探讨。

1950年代，美国生物学家詹姆斯·鲍威尔曾前往刚果进行一次深入的生物考察。在与巴图族长者的交流中，鲍威尔了解到，他们相信姆博肯贝是一种活在水中的巨兽，会在夜晚悄悄潜入河边，吞噬任何接近它的人或动物。这种传说在当地流传已久，而鲍威尔认为，虽然这些故事带有神话色彩，但它们很可能基于某种曾经在这一地区栖息的巨大动物的记忆。

鲍威尔的报告虽然未能提供任何确凿的证据，但却激发了更多探险家的兴趣。之后的几十年里，多支探险队前往刚果，试图寻找传说中的姆博肯贝，也即莫图卡。

近年来，随着科学技术的进步，探险家们装备了更多高科技设备，希望能揭开莫图卡的真面目。2009年，一支由英国和刚果科学家组成的联合探险队在刚果河流域进行了一次大规模的考察。这次探险的重点是使用声呐和水下机器人进行探测，以期发现任何可能存在的大型水生动物。

团队的负责人迈克尔·罗伯茨表示：“我们的目标是获取无可辩驳的物理证据，来证明或反驳这些传说。”他们在几个潜在的高频目击区域布置了声呐设备，并使用水下机器人进行了详细的拍摄和勘测。

几周的探索努力并非完全无果。在一次深潜任务中，水下机器人拍摄到一个模糊但明显的巨大物体从摄像头前快速移动过去。虽然影像模糊，但物体的形状和体型引起了科学家的极大兴趣。罗伯茨说：“虽然我们无法确认这是什么，但它并不符合已知的任何大型水生动物的特征。”这段影像随后被反复分析，尽管科技手段未能进一步揭示其真相，但它成为了莫图卡存在的有力支持之一。

此外，探险队还发现了一些巨大的足迹，这些足迹的形状与已知的鳄鱼或其他爬行动物不符。它们似乎属于某种未知的大型动物，进一步激发了人们对莫图卡真实存在的兴趣。